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在付出了不知道多少生命的实验之后，人们终于掌握了化龙素的安全版本，注射之后的战士，都拥有了那种神奇的力量，尤其是活下来的凌风，身体素质几乎是飞跃一般的提升着。
在身体素质提升到某种程度之后，凌风体内忽然出现了一种奇异的能量，这种能量按照某种特定的路线循环着，并且在战斗时能够按照凌风的意志运行到身体的各个部位，使得他的力量和速度更加极大的提升，到了这个时候，他仅凭一个人，就可以摧毁数十架机器人。
而其他注射了化龙素的战士，也像凌风一样不断的增强着身体素质，在经过一段时间之后，体内也出现了那种奇异的内循环能量。
这种能量十分像是中华古代传说中的“内力”，袁显图教授将之命名为：内能。
抵抗军拥有了成熟的化龙素，源源不绝的强大战士被制造出来，人类终于在对抗变异兽和机器人的战争中取得了优势。失地被不断的夺回，人类的生存区域一点点壮大，人们又重新看到了希望。
但新的问题出现了，凌风的强大引起了抵抗军内高层的忌惮，担心他有朝一日会失去控制，于是一场针对凌风的阴谋发生了。
那一战，抵抗军出动一百名最强大的战士对凌风发动了突袭，但最终的结果，却是凌风在战斗中进一步升华，体内的内能发生了新的变化，凝结成为了一种类似于固体的光团。
升华后的凌风，就像是传说中的神明一样强大而可怕，抵抗军的一百名战士只活下来三人，其余全灭。
这一战之后，凌风离开了抵抗军，孤身一人前往机器人和变异兽肆虐的远方大陆，建立了自己的独立势力，也就是现在北方的最强国度——风云武域。
一百名精锐战士死伤殆尽，抵抗军元气大伤，原本以抵抗军为首的人类抵抗联盟就此分崩离析。
分散的人类联盟在面对变异兽和机器人时已经没有了优势，而轩辕在研究过人类的精英战士后，有针对性的研发出了更高端的机器人。
拥有着人类所有的科技储备和自我意识，轩辕的科技创新能力呈几何级增长，人类再次遭到了机器人大军的反扑，生存岌岌可危。
无奈之下，人类重新建立了联盟关系，但这种关系已经没有以前可靠，不过也使得人类短时间内重新振作了起来。
在僵持了数年之后，轩辕对人类发动了一次毁灭级的战略打击，麾下机器人几乎倾巢而出，就在人类联盟生死存亡之际，凌风带着风云武域的援军赶到，一场激战之后，终于将机器人大军击溃，人类得以继续苟延残喘。
在这样的背景下，人类平安的又过了几十年，风云武域也重新加入到了人类联盟之中。一批批天才战士成长起来，人类对内能的认识也越来越成熟，与内能运用相匹配的武学发展迅速，呈现出百家争鸣的繁荣景象。
当初参与围剿凌风而活下来的三名抵抗军战士，各自建立了自己的势力，也就是现在亚洲的最强三大势力：战龙国、东溟海和沙漠联邦。
轩辕控制的地域不断被人类夺回来，大量的变异兽被猎杀和驯化，人类的科技重新开始发展，以变异兽身体为材料的内能生物科技诞生，人类制造出了与武学相配套的各种兵器和铠甲，实力极大提高。
在一位无法修炼出内能的科学家的努力下，用变异兽的身体材料成功制造出了第一架战斗机甲，使得普通人也可以成为战士。
这名科学家对机甲不断的优化，最终成功的开发出以脑电波操控机甲的系统，使得机甲的战斗力进一步提高，已经可以媲美强大的武者。
相比需要有修炼内能天赋的武者而言，平民中诞生的机甲操控高手，受到了更多的欢迎和崇拜，五年后，一位号称最强机师的明星战士，在一场生死战斗中忽然觉醒了特殊的能力，他的精神力竟然能够外放并实质化，并且可以像雷达一样感知到周围的环境和物体。
人类就此开启了对大脑和精神力的研究，并最终发现，这种强大的精神力，也像是内能一样，是某种与生俱来的天赋。
这名机师在战斗中逐渐成长，到了后来，他的精神力进一步升华，甚至可以干扰生物体的思维和机器人的智能运行信号。
在一次与武者的测试战斗中，这名机师成功的使武者出现幻觉，最终以碾压性的优势战胜了这名武者。
自此，人类开始双管齐下，内能和精神力同步发展，数不清的天才雨后春笋般涌现，甚至出现了具有内能和精神力两种天赋的超级精英。
一场针对机器人的总攻开始酝酿，所有人都认为，如今人类的实力，完全可以轻而易举的彻底摧毁轩辕，重新成为地球的主人。
但历史总是相似的，悲剧总会重演。因为一个微不足道的原因，具体的内情已经说不清楚，大概是风云武域和战龙国的两名武者发生了冲突，双方一场大战，各自叫来了帮手，没想到战斗不断的升级，最终竟然达到了不可控制的地步。成为了一场人类联盟和风云武域的双边战争。
也许是凌风当年的遭遇始终是风云武域中人心中的刺，也许是人类联盟始终对风云武域有所防备，大战一开始，风云武域就节节败退，几乎到了被灭国的边缘。
但就在最后时刻，已经几十年未见的凌风忽然出现，以不可思议的手段强杀三大势力的首脑，风云武域趁势反击，人类联盟再一次遭受了毁灭性的打击。
就在战争焦灼状态之时，轩辕研发的新一代军队，以人工智能技术与变异兽结合的智能兽忽然出现，对人类发动了突袭。
许多强大的变异兽本身拥有内能，但因为智慧层次较低，所以无法在面对人类时获得优势，但经过轩辕人工智能的结合，这些智能兽实力强大无比，而且拥有严密的组织架构和成熟的战术战略，人类再一次面临灭亡的边缘。
无奈之下交战的双方只好停战，共同面对轩辕。