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医学论文有多种类型，其表达形式也有所不同，但无论哪种医学论文，作者在撰稿时均须遵循以下基本原则和要求。
1科学性科学性是指论文要言之有理，言之有据。科学性原则是医学论文的生命，是衡量医学论文的首要条件。没有科学性，论文就将失去它的价值。科学性原则要求论文设计严谨周密，论据真实，研究方法可靠，运用科学的原理进行严密细致而富有逻辑的论证，得出科学的结论；要求论文的内容、观点必须符合医学发展的客观规律，不能含有作者主观臆断的成分。科学性的具体表现包括:（1）真实性，即论文的数据资料必须真实、确凿可靠，实事求是，不能有虚假成分，要真实地反映事物的本来面目。（2）准确性，即论文要客观、准确、全面地反映研究的真实情况，如总结经验时，除了成功的经验，失败的教训也要总结；准确性原则还要求引文来源要准确，用词要准确，结论要恰当。（3）逻辑性，就是用科学的逻辑思维方式对收集到的数据资料进行综合，分析，概括，推理，概念明确，判断恰当，思路清晰，论述透彻，使论文结构严谨，层次清楚，论据充分，结论正确。
2创新性创新性是医学论文的灵魂，是衡量医学论文质量的主要标准。创新性是指论文在学术上或技术上要有自己的独到见解，有新的发现。
3实用性实用性是指医学论文的实用价值。临床医生撰写医学论文，目的就是推广自己的成果和经验，以解决临床实际问题。衡量一篇医学论文的实用价值主要是看其社会效益和经济效益。要使医学论文有较高的实用价值，作者在撰写时首先应注意在选题时要选择那些临床迫切需要解决的问题，能指导和帮助别人解决理论和实际工作中的问题；其次，在总结成文时详细介绍研究对象的入选标准、治疗方法、具体细节和步骤，以便他人重复。
4规范性标准化、规范化是现代科技期刊的基本要求，越来越引起人们的重视，计算机技术为医学期刊编排格式现代化提供了先进手段。为了使医学文献工作走向通用化、系统化、国际化，达到文献信息交流的目的，要求医学论文的撰写格式符合一定的规范性要求。并在全世界范围内被许多国家和地区的生物医学杂志所采用。我国国家技术监督局参照国际标准于1992年颁布了科学技术期刊编排格式的国家标准。国家标准和国际标准对学术论文的题目、作者、摘要、关键词、前言、方法、结果、讨论和参考文献的写法都有严格的要求；对图、表的制作，数字的正确使用，计量单位、医学名词术语、缩略语、标点符号都要求规范。对不符规范要求的论文，编辑部一般给予退修，这些论文也往往因不规范而影响其应用价值。
5可读性。论文发表是为了让他人或后人所利用，因此医学论文一定要有可读性，否则达不到交流的目的。论文的可读性是指论文的表达方式要符合文法要求，论文不管是用中文书写，还是用英文书写，都要注意语法修辞的正确性。在具体撰写医学论文时，要注意文字简洁、语法正确、修辞准确、语句通顺、词语搭配得当，标点符号使用正确，表达清晰，层次分明，段落衔接通畅易懂。也只有达到上述要求，读者才能用较少时间准确无误地理解论文的内容。
二怎样写好论文论著，是报道基础医学、临床医学、预防医学研究成果和实践经验的最主要的论文体裁之一。
医学期刊对论著类论文的写作格式有严格的要求。论著类论文一般分为以下几个部分，即论文题目、作者姓名及单位、摘要、关键词、前言、材料（资料或对象）与方法、结果、讨论、致谢、参考文献等。下面着重谈一下材料（资料）与方法的写作方法。1论文题目2作者署名及单位3摘要4关键词5引言6材料（资料或对象）与方法此部分内容应详细介绍本研究工作选择的对象、所用的材料和采取的研究方法。这样做的目的，一方面是通过客观的描述，使读者清楚了解研究工作的对象和过程；另一方面，使读者能够应用同样的材料和方法，对研究结果进行重复和验证。因为不能重复验证的研究结果，在科学上是不被承认的。临床医学论文的研究对象主要是患者。在材料与方法中，首先要介绍清楚研究对象的选择标准及剔除标准，资料的来源是前瞻性，还是回顾性，资料来源的时间及地点（即何时何单位收治的患者），数量及分组原则（如是否是随机分组，是否为连续病例），还应介绍清楚患者的年龄、性别、临床分期分型等对研究结果有一定影响的重要的临床特征。如果是以动物为实验对象，应说明动物的来源种系、性别、体重、健康情况及分组方法等。临床疗效类研究论文要在材料与方法中说明治疗措施，给药的详细方法，安慰剂和对照的使用等；在实验研究中包括各种实验干预手段、实验环境条件等，诊断试剂和试验药品要写明批号及配制方法等；观察实验效果应注明测试样品的采集、检测项目的方法，测试仪器的厂家和系列号、性能、检测数据的统计学处理等。材料与方法中，还应注意介绍评估判别方法，评估判别的标准，判定正常与不正常的参数界限，参数可以是定性的也可以是定量的，计量单位按国际规范或国家规定的要求使用。确定判别标准后还应介绍统计分析方法。若采用新的复杂的统计方法，则要作一简介并注明参考文献。临床类论文最常涉及到疗效评定标准，一定要注明所采用的标准出自何处，如果是自己制定也一定要写清楚。在叙述材料与方法时，必须准确、具体、真实。如果所采用的方法是前人或他人的，要注明文献出处；如果是对前人或他人的方法进行了一定的改进，则要交代清楚改进之处；如果是自己提出的方法，除涉及保密内容外，要作详细描述，以便他人能重复。方法的设计及叙述直接关系到论文的科学性。临床研究的病例必然涉及到诊断标准，诸如老年性慢性支气管炎、肝炎等需要根据有关规定或惯用的标准选择病例。临床疗效评价应尽量设立对照组，且需随机分为治疗组和对照组，不得有人为的偏性。疗效判断可分为痊愈、显效、进步、无效四级，而临床有效率仅包括痊愈与显效两项，并不包括进步，否则会造成高疗效的假象。方法的叙述应根据研究工作的逻辑顺序，不同论文。在材料与方法中所要描述的细节也略有不同，应视论文具体的研究内容而定。如果论文是以病例为观察单位的临床研究论文，材料与方法也可写成资料与方法或对象与方法。此时材料部分要尽量详细具体，方法部分则有较大的伸缩性，属于创新的方法要尽量详细，精确描述，以便他人重复验证，通用的方法则提到即可。根据国际生物医学期刊投稿统一要求，以病例为观察对象时，不能使用患者的姓名、地址，不能写出患者在医院内各种检查的编号及病历号。如果论文的数据资料涉及到统计学处理，一定要在材料与方法中介绍是采用了何种统计方法。如果是用统计软件进行的统计学处理，还应说明所用统计软件的名称及版本。